Το Bifidobacterium μπορεί να αναστέλλει αποτελεσματικά την κοινή αλλοίωση και χαμηλή - βακτηρίδια θερμοκρασίας. Το αντιβακτηριακό του αποτέλεσμα είναι κυρίως μέσω του ανταγωνισμού των θέσεων διατροφής και προσκόλλησης, η παραγωγή αντιβακτηριακών ουσιών και η ενίσχυση της ασυλίας του σώματος. Έχει επίδραση στην πρόσφυση και την αναπαραγωγή των εντερικών παθογόνων βακτηρίων. Στον ανταγωνισμό και στην παρεμπόδιση της παθογένεσης της νόσου. Οι αντιβακτηριακές ουσίες που παράγονται από τα bifidobacteria είναι κυρίως οργανικά οξέα, βακτηριοκίνες, βακτηριοκίνες και άλλες αντιβακτηριακές ουσίες.
Τα πτητικά βραχίονα - αλυσίδα λιπαρών οξέων όπως το γαλακτικό οξύ και το οξικό οξύ, τα οποία είναι μεταβολίτες των bifidobacteria, αυξάνουν τη συγκέντρωση ιόντων υδρογόνου στο περιβάλλον, τα οποία είναι υψηλότερα από τη συγκέντρωση ιόντων υδρογόνου στα κύτταρα παθογόνων βακτηρίων. Τα ιόντα υδρογόνου διεισδύουν στα κύτταρα των παθογόνων βακτηρίων για να τα εξορύσσουν την οξίνιση του κυτταροπλάσματος επηρεάζει την ανάπτυξή του και ακόμη και απενεργοποιεί τα παθογόνα βακτήρια για να επιτευχθούν αντιβακτηριακά αποτελέσματα.
Μελέτες έχουν δείξει ότι ο ζωμός ζύμωσης Bifidobacteria έχει προφανές αντιβακτηριακό αποτέλεσμα in vitro και το χαμηλό pH είναι μια σημαντική κατάσταση για το αντιβακτηριακό του αποτέλεσμα. Επιπλέον, ορισμένα bifidobacteria μπορούν να μεταβολιστούν για να παράγουν μια πρωτεΐνη που συντίθεται με ριβοσώματα με αντιβακτηριακά αποτελέσματα, που ονομάζονται βακτηριακές τοξίνες, οι οποίες μπορούν να αναστέλλουν την ανάπτυξη άλλων παθογόνων βακτηρίων.